Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	17420	17462	43	45 [0]	[0] 44	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

TATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCG  >  minE/17463‑17524 |                                                              tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCGCCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:396843/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:765727/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:1008785/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:49061/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:519063/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:595206/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:664711/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:701166/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:7342/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:749567/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:751577/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:472056/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:778689/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:803979/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:825297/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:886069/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:895844/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:908378/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:918335/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:963358/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:964403/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:401978/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:1020816/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:10814/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:1113129/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:1146917/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:1176150/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:139185/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:155147/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:244413/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:251707/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:270954/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:273062/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:319919/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:32200/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:35310/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:364821/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:391208/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:393086/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:427370/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGGGAACTATCg  <  1:860768/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAACCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:309316/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCATAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:746714/62‑1 (MQ=255) tATCGCTATGCAGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCg  <  1:762130/62‑1 (MQ=255) |                                                              TATCGCTATGCCGATAAAATGTTCACCTTAAGCCAGGAAATGCTGGATATTGTGAACTATCG  >  minE/17463‑17524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑