Missing coverage evidence...
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CTGGCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCA  >  minE/598867‑598929   |                                                             cTGGCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAG‑GGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:358425/62‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:597213/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:36838/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:439470/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:4441/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:455052/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:520092/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:523677/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:593454/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:305945/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:600448/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:708947/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:734214/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:792910/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:848767/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:885595/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:92392/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:927464/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:126119/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1014410/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1021475/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:105718/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1074653/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1088997/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1163110/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:1186905/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:101013/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:137462/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:139994/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:153056/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:185125/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:195049/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:258002/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCa  <  1:273735/61‑1 (MQ=255)   ggCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGAGTGAAGGTTCa  <  1:1077913/61‑1 (MQ=255)   |                                                             CTGGCGATTCTGACCGGTAACGTTGGTATTAACGGAGGCAACAGCGGCGCGCGTGAAGGTTCA  >  minE/598867‑598929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑