Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	668870	668910	41	11 [0]	[0] 59	pqiA	paraquat‑inducible membrane protein A

TGAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGA  >  minE/668911‑668956 |                                              tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACTTTACTGGa  >  1:955531/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTgg   >  1:160176/1‑45 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:634134/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:39690/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:404502/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:409916/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:418817/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:424709/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:431304/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:432479/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:474157/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:519910/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:551586/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:584360/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:599345/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:631529/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:370526/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:640895/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:642212/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:662139/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:695924/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:695938/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:711951/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:76904/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:81142/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:867279/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:900831/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:918276/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:953808/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:961496/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:146019/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1017979/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1044284/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1062321/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1068998/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1070457/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1075913/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1111831/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1118907/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1127523/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1136435/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1175643/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1184548/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:136985/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:142063/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:382154/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:171126/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:198952/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:200896/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:209551/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:220598/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:223629/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:232686/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:266165/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:268566/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:298532/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:298981/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:362715/1‑46 (MQ=255) tgAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGa  >  1:1015907/1‑46 (MQ=255) |                                              TGAATATGAACGTTGCAGGAGTTACCAGTGAAATTACATTACTGGA  >  minE/668911‑668956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑