Missing coverage evidence...
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GCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGATT  >  minE/716663‑716722 |                                                            gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCTAtt  <  1:829299/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:825893/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:632629/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:655624/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:705544/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:708131/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:737788/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:780177/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:790344/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:812419/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:10753/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:839633/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:861385/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:870890/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:895026/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:917984/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:927279/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:940314/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:538077/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:1044316/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:1088042/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:1097125/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:1135273/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:1172052/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:121451/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:154768/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:169685/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:250816/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:277640/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:309080/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:316492/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:341035/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:371249/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:428145/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:531988/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:568539/60‑1 (MQ=255) gCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGACTGCTATCTCGGTTATTCGAtt  <  1:967344/60‑1 (MQ=255) |                                                            GCCAATTTTTCCAATGTTGTTCGTGGCTCTTTTCATGCCTGCTATCTCGGTTATTCGATT  >  minE/716663‑716722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑