Missing coverage evidence...
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CCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATT  >  minE/738031‑738091 |                                                             ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGTCAtt  >  1:865051/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:443417/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:99692/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:980422/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:902845/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:846574/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:793209/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:784288/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:732626/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:635577/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:613671/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:1060140/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:437966/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:254123/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:231794/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:219087/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:199257/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:184325/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:150215/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:1182163/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:1136284/1‑61 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAt   >  1:39637/1‑60 (MQ=255) ccTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCATGGCAtt  >  1:353909/1‑61 (MQ=255) ccTTCATCTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCAtt  >  1:964113/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATT  >  minE/738031‑738091

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑