Missing coverage evidence...
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TTATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGAA  >  minE/749654‑749715 |                                                              ttATTGTAATAAACATATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:744655/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCgg               >  1:739528/1‑49 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:570339/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:991554/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:980101/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:93085/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:877315/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:811253/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:776699/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:723194/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:511663/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:475900/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:34963/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:298391/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:292073/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:280750/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:204524/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGaa  >  1:140418/1‑62 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGa   >  1:1018690/1‑61 (MQ=255) ttATTGTAATAAACAGATAAGAATGATTTATGCATGGTGCCAGTCTCGGATAGTGCATGGaa  >  1:502847/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTATTGTAATAAACAGATAAGCCTGAATTATGGATGGTGACAGTGTCGGATAGTGCAGGGAA  >  minE/749654‑749715

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑