Missing coverage evidence...
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CGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAA  >  minE/755665‑755706 |                                          cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCTGTTAaataa  <  1:443030/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:719953/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:638527/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:63853/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:667558/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:671001/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:682884/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:684159/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:709043/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:578358/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:75590/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:785866/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:788606/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:831317/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:832749/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:858449/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:947927/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:962561/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:310134/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:1075904/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:157633/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:188782/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:198325/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:24790/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:251333/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:260832/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:280823/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:603966/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:324028/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:326556/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:443312/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:511576/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:545368/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:1020778/42‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCGCTT‑GCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa  <  1:392368/41‑1 (MQ=38) |                                          CGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAA  >  minE/755665‑755706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑