Missing coverage evidence...
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CTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTGG  >  minE/781003‑781064 |                                                              cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATTAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:517359/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:77670/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:571296/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:590200/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:616357/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:622855/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:645601/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:666398/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:669392/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:517019/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:78221/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:829528/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:84314/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:85463/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:912247/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:949346/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:976205/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:495219/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:1114080/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:1142680/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:1165935/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:160072/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:214566/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:238378/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:247171/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:254274/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:267836/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:278611/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:293641/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:299755/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:310467/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:31888/62‑1 (MQ=255) cTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:1060806/62‑1 (MQ=255) cTGGTCATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTgg  <  1:1079717/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTGGTTATAAGGTGCGTTTTAACGTAATGGCGGAACACCTGATGAGCGATGTACCTTTCTGG  >  minE/781003‑781064

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑