Missing coverage evidence...
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GCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGA  >  minE/44245‑44306 |                                                              gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCg                >  1:1102026/1‑48 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTggg   >  1:34060/1‑61 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTggg   >  1:12577/1‑61 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTgg    >  1:662084/1‑60 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:651655/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:374019/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:38458/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:387956/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:495432/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:502933/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:545922/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:622110/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:63420/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:337394/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:672844/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:701503/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:711072/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:747157/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:863650/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:865236/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:877280/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:884435/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1174032/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1034236/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1045697/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1071889/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1072193/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1092908/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1132743/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1135563/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1145600/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1021818/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:1191936/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:134607/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:14177/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:156996/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:188774/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:27698/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:292662/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGAAAATCGTTGGTTTGTTGGGa  >  1:5664/1‑62 (MQ=255) gCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACATTTGGCCCGCaaa                   >  1:1076690/1‑45 (MQ=255) |                                                              GCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGA  >  minE/44245‑44306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑