Missing coverage evidence...
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CAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGC  >  minE/844995‑845056 |                                                              cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCATCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:283089/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:924040/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:1052476/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:891403/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:879535/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:865858/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:857688/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:844125/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:811085/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:77337/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:647285/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:63723/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:474483/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:448385/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:365376/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:356788/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:282095/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:278869/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:271908/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:260583/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:259112/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:233195/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:230314/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:227867/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:192085/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:175829/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:126876/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:1116572/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:1098645/62‑1 (MQ=255) cAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGc  <  1:1069645/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAACAGGTTAAAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGC  >  minE/844995‑845056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑