Missing coverage evidence...
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TTGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTC  >  minE/868356‑868417 |                                                              ttGCCGCCATTATTGTCATTGTTGCTCAAGGtaataa                           >  1:1169152/1‑37 (MQ=37) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGTGTc  >  1:947234/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGTTc  >  1:513795/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGt   >  1:114236/1‑61 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGt   >  1:813625/1‑61 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:888452/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:879938/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:919555/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:797804/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:776746/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:77067/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:631731/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:611641/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:567043/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:550900/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:921445/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:456025/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:407209/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:327188/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:287377/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:2620/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:241082/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:240710/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:173469/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:161212/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:142716/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:130571/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:121619/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:1168473/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:1167726/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:1165768/1‑62 (MQ=255) ttGCCGCCAGTATTGTCATTGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:695215/1‑62 (MQ=255) ttGCAGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCAAGCGTGGCGAGTTACGGGTc  >  1:690275/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGCCGCCATTATTGTCAATGTTGCTCAACGTAATAAACGCCAGCGTGGCGAGTTACGGGTC  >  minE/868356‑868417

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑