Missing coverage evidence...
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TGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGTT  >  minE/877529‑877589 |                                                             tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGATATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:120478/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATTTTCGTTATTGGGGtt  <  1:296004/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:277470/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:91220/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:881768/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:783476/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:783326/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:617993/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:572079/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:405096/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:389119/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:284790/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1017580/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:182372/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:148442/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:142222/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:117801/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1159579/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1124773/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1114801/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1094001/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGtt  <  1:1060983/61‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGATCGTTATTGGGGtt  <  1:588213/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGTTCAGCAAATGGCCCATTTTCTCGGCTTTGGTATCGAGATAATGTTCGTTATTGGGGTT  >  minE/877529‑877589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑