Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	48864	49158	295	2 [0]	[0] 15	[apaH]–[apaG]	[apaH],[apaG]

TGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAG  >  minE/49159‑49220 |                                                              tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:1009938/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:1092565/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:1170759/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:1176215/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:166236/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:171853/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:213004/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:239717/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:248385/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:486139/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:501833/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:679114/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:734123/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:771507/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAg  <  1:971930/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAG  >  minE/49159‑49220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑