Missing coverage evidence...
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TGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGC  >  minE/910116‑910176 |                                                             tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCAttt                          >  1:761755/1‑37 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGgcagc            >  1:1021341/1‑51 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCg   >  1:1078029/1‑60 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCg   >  1:872263/1‑60 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:653057/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:989548/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:671993/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:67769/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:684995/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:689397/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:732584/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:733188/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:756704/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:778340/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:816689/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:819892/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:822828/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:838988/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:884246/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:988292/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1015277/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:537239/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1050786/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1052176/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1082150/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1103611/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1115548/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:1116918/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:194594/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:251233/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:363383/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:366115/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:384358/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:410242/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:425375/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:444185/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:52083/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:536495/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:570139/1‑61 (MQ=255) tGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGAATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGc  >  1:290595/1‑61 (MQ=255) tGGATCGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAgg                     >  1:983617/1‑42 (MQ=255) |                                                             TGGATGGTGTAATCACCGATACCGCGCATCTGCATTTCCAGGCGTGGCAGCAGATTGCCGC  >  minE/910116‑910176

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑