Missing coverage evidence...
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GGCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCTCAT  >  minE/927937‑927998 |                                                              ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGt                            >  1:161966/1‑36 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGa                          >  1:1157110/1‑38 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:833799/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:557670/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:562676/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:621469/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:66803/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:707774/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:729803/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:824079/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:82891/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:1065380/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:84491/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:898191/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:930890/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:933052/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:974215/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:996872/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:529450/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:103192/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:1098568/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:124325/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:177769/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:194482/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:220039/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:266132/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:283230/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:353195/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:46263/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:470338/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtcat  >  1:532529/1‑62 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtca   >  1:900782/1‑61 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtca   >  1:981926/1‑61 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtca   >  1:998457/1‑61 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCtc    >  1:971925/1‑60 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCt     >  1:303027/1‑59 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCt     >  1:331400/1‑59 (MQ=255) ggCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCt     >  1:343878/1‑59 (MQ=255) |                                                              GGCTGAGATAAAGCCCAGAGCCGCCGCCGTTTCGGTGACGGCTTCTTTATGAGCTTGCTCAT  >  minE/927937‑927998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑