Missing coverage evidence...
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TACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGCC  >  minE/53560‑53621 |                                                              tACGCGTCTCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:485673/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:296104/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:944334/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:882873/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:881540/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:868946/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:725829/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:631057/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:541107/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:519867/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:455558/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:433049/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:422884/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:419432/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:373595/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:359134/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1018874/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:274476/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:255003/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:254729/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:250280/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:246249/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:218068/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:177082/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:122736/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1177189/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1155597/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1106874/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1099092/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1048949/62‑1 (MQ=255) tACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGcc  <  1:1028384/62‑1 (MQ=255) |                                                              TACGCGTATCAAACGGACCAACATCATTCTGGTAGTAATTAACGTCTAACTGCGGCTCTGCC  >  minE/53560‑53621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑