Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	971244	971263	20	6 [1]	[1] 42	lsrC	AI2 transporter

TTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGC  >  minE/971260‑971324     |                                                             ttACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATagca      <  1:808882/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:742563/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:552612/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:588573/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:595602/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:603065/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:63178/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:636019/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:669982/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:698052/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:716872/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:738649/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:519763/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:749090/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:790457/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:815535/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:817292/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:824922/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:900676/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:913686/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:919355/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:25150/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1028921/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1046063/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1094985/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1135815/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1160621/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1186836/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:133238/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:177525/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:186881/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:238909/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:1005714/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:257504/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:270462/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:326789/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:353405/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:360642/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:37038/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:4052/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:440062/61‑1 (MQ=255)     ccGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAgcgc  <  1:506100/61‑1 (MQ=255)     |                                                             TTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGC  >  minE/971260‑971324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑