Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	987606	987771	166	2 [0]	[0] 33	ynfE	oxidoreductase subunit

CTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGTT  >  minE/987772‑987833 |                                                              cTCAAGCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:855403/1‑62 (MQ=255) cTCAACGTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:1172264/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:501791/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:979806/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:848650/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:816133/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:805852/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:727691/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:661674/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:653720/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:643710/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:637642/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:572579/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:1071260/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:450425/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:260521/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:114813/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:1182239/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:147814/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:154306/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:449812/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:280757/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:331007/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:384217/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:423453/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGt   >  1:380637/1‑61 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGt   >  1:560204/1‑61 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCACACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:120472/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCCGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:8997/1‑62 (MQ=255) cTCAACCTTTGAAGGCTGAAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:764899/1‑62 (MQ=255) cTCAACCGTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGtt  >  1:633273/1‑62 (MQ=255) cTCAACCATTGAAGGATGTAACTCCCCTGAACGTAg                            >  1:344945/1‑36 (MQ=37) cTCAAACTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGa                           >  1:738510/1‑37 (MQ=255) |                                                              CTCAACCTTTGAAGGCTGGAACTCCCCTGAACGTAGAACCTTCCCACTGCAACTGTTTGGTT  >  minE/987772‑987833

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑