Missing coverage evidence...
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GACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCG  >  minE/1031793‑1031854 |                                                              gACATTCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:35705/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:720286/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:42512/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:460901/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:490152/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:570685/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:63074/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:641582/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:678265/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:682523/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:697154/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:701096/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:421758/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:730495/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:824596/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:826046/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:833640/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:852343/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:874133/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:878260/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:964353/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:968667/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:971505/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:113741/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1011370/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1015225/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1020854/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1039412/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1040418/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1051963/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1064925/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1083685/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1105847/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1108600/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1000749/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:1170347/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:148306/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:178058/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:219015/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:246052/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:282476/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:296355/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:346434/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:376058/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:387521/62‑1 (MQ=255) gACAATCAGGGCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg  <  1:731042/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCG  >  minE/1031793‑1031854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑