Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1048333	1048358	26	9 [0]	[0] 72	slyA	DNA‑binding transcriptional activator

CCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGG  >  minE/1048359‑1048421 |                                                               ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATTTTGTGTTACGTAACCCAATgg   >  1:162469/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc        >  1:751682/1‑57 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCaa      >  1:1041951/1‑59 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:69148/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:723420/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:716505/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:715772/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:708674/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:702570/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:701026/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:695199/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:577721/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:689848/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:686314/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:686209/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:646921/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:637797/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:631645/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:600818/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:534337/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:73530/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:761606/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:776670/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:802152/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:802926/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:811845/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:816090/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:839064/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:880908/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:887676/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:907044/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:918602/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:924846/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:956746/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:965951/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:975537/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1160126/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:100452/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:22080/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:22014/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1201052/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1201018/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1190277/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1179607/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1160204/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:249089/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1122851/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1089562/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1084843/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1083722/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1082526/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1078566/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1062037/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:1019411/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:268764/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:520898/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:517283/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:499430/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:470248/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:432311/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:427963/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:420819/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:410737/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:35824/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:35122/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:338318/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:309302/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:283572/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATgg   >  1:265553/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACACAATg    >  1:12191/1‑61 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATT‑TGTAACGTAACCCAATggg  >  1:558295/1‑62 (MQ=255) ccAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGCAGGTAACTGATGGatat                       >  1:685708/1‑42 (MQ=255) |                                                               CCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGG  >  minE/1048359‑1048421

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑