Missing coverage evidence...
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GTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACC  >  minE/1051851‑1051912 |                                                              gTTCACCGCCACCGGCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:600743/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCgccgcc            >  1:281565/1‑52 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACTTGGAcc  >  1:572521/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGt       >  1:673495/1‑57 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:794435/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:676155/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:701319/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:723448/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:726299/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:737927/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:758018/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:786876/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:650492/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:819160/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:838235/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:839619/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:846431/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:870508/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:903655/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:946334/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:983335/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:995950/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:996270/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:248182/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:1100672/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:112575/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:1163829/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:156866/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:157857/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:202771/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:236546/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:260285/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:26441/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:32121/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:434308/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:448106/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:529813/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:557522/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc  >  1:1039508/1‑62 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc   >  1:666979/1‑61 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc   >  1:175402/1‑61 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc   >  1:529805/1‑61 (MQ=255) gTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc   >  1:973372/1‑61 (MQ=255) |                                                              GTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACC  >  minE/1051851‑1051912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑