Missing coverage evidence...
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ACAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAGCGGC  >  minE/1058354‑1058415 |                                                              aCAGGGTGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:598470/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTCCCAgcggc  <  1:915149/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:738696/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:485486/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:491470/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:528212/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:545363/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:570089/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:590414/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:605275/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:678167/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:710486/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:720198/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:483285/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:776651/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:857636/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:859815/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:866211/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:913932/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:947338/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:954058/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:959177/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:998335/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:160492/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1086522/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1088656/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1094169/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1109434/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1126351/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:114033/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:11443/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1147588/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:1190234/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:126760/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:14780/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:106440/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:161288/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:175533/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:197798/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:229948/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:267033/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:277044/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:378476/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:413918/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:419191/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:470387/62‑1 (MQ=255) aCAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGAACTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAgcggc  <  1:639804/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACAGGGAGACCGGGATATTGACCGCCCGACCTGGCGCTCAATTGTTGGCGGTTACCAGCGGC  >  minE/1058354‑1058415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑