Missing coverage evidence...
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CGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACA  >  minE/1070282‑1070343 |                                                              cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:484422/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:995366/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:95402/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:93989/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:921842/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:884812/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:792079/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:726876/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:718654/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:664956/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:650675/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:550140/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:532752/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:1030940/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:484164/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:429931/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:278890/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:257014/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:220561/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:160311/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:137463/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:126286/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:122360/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:1199696/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:1134802/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:1132251/62‑1 (MQ=255) cGATTTCAGATCACGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca  <  1:828889/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACA  >  minE/1070282‑1070343

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑