Missing coverage evidence...
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TTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCT  >  minE/1112429‑1112490 |                                                              ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGgtgt                     >  1:825005/1‑43 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGc   >  1:1017009/1‑61 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGc   >  1:267788/1‑61 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:994478/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:1002720/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:924843/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:908834/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:89426/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:855220/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:850417/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:659959/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:598845/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:592111/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:582983/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:466169/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:422101/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:402213/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:365156/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:335471/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:3343/1‑62 (MQ=255) ttcttcAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCt  >  1:119790/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTCTTCAGTTCAGCCAGGCTTAACCAGGTTTGCACCACGGTGTCCGGGTTCAGAGACAGGCT  >  minE/1112429‑1112490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑