Missing coverage evidence...
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CCAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGA  >  minE/1149342‑1149403 |                                                              ccAGACACTCCGCAAGCCTTACCCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:309580/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTaa                    >  1:1025736/1‑44 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACtt                 >  1:34197/1‑47 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATg   >  1:717385/1‑61 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:709277/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:987925/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:519510/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:545047/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:60104/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:974353/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:629885/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:96733/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:640384/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:660156/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:675095/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:95418/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:71282/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:480649/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:772486/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:821458/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:834741/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:863921/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:866239/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:90860/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:929877/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:149350/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1028020/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1028366/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1044000/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1065923/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1108569/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1124979/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1134232/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:118547/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:133317/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:492400/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1553/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:160938/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:179205/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:18078/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:19485/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:200730/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:318136/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:406832/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:412810/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:473213/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAGCATTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:1052527/1‑62 (MQ=255) ccAGACACTCCGCAAACCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGa  >  1:886197/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCAGACACTCCGCAAGCCTTAACCTGCTTCCATGCTCTGGGTAACTTGCGAAACCAACATGA  >  minE/1149342‑1149403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑