Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	78411	78415	5	50 [0]	[0] 38	murE	UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase

GGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACA  >  minE/78416‑78477 |                                                              gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:804768/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1015159/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:536423/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:540345/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:550354/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:561417/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:583386/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:661849/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:79857/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:802449/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:527328/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:862223/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:885733/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:892575/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:906004/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:94544/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:992371/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:992778/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:998187/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:197856/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1058371/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1065169/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:111310/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1117627/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1142202/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1174085/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:1187434/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:141715/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:175701/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:482092/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:262299/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:262867/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:329050/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:329169/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:35739/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:459518/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:470607/62‑1 (MQ=255) gggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTAGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACa  <  1:725907/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACA  >  minE/78416‑78477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑