Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1183246	1183445	200	6 [0]	[0] 33	mipA	scaffolding protein for murein synthesizing machinery

ATTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAC  >  minE/1183446‑1183507 |                                                              aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCt                            >  1:372757/1‑36 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGgtg                 >  1:450159/1‑47 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCACCGCCACCTAc  >  1:881934/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCACCGACACCTAc  >  1:916183/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:417083/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:967724/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:768622/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:714363/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:667892/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:618902/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:575022/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:448102/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:448083/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:433011/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:424067/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:418162/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:403293/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:1037223/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:10684/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:1092989/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:1167569/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:147855/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:165287/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:172364/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:206118/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:206123/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:277180/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:291995/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:321583/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:364223/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:1015000/1‑62 (MQ=255) aTTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTAAACGACACCTAc  >  1:957465/1‑62 (MQ=255) aTTACAGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAc  >  1:589114/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATTACCGGTACTGGGTAAACATCGGTATCGTAATCTTTATATGGGTGTTCAACGACACCTAC  >  minE/1183446‑1183507

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑