Missing coverage evidence...
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AAGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAC  >  minE/1206105‑1206166 |                                                              aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGGTAc  <  1:808860/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:694698/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:521198/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:540575/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:609978/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:619425/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:627482/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:648803/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:6608/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:693542/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:517566/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:735346/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:750502/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:786423/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:786940/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:809901/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:826265/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:892197/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:232262/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:1064672/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:1106227/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:1144103/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:1161408/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:117443/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:155112/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:20530/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:214098/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:1003285/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:287701/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:350091/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:415694/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:424009/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:473148/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:480887/62‑1 (MQ=255) aaGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAc  <  1:509364/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAGTACAACGCTCAGTTGGCAAAACTCGACACCACTAAAGGCGTGCTGTTTCTCGTTGATAC  >  minE/1206105‑1206166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑