Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207254	1207296	43	2 [1]	[0] 20	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

CCCTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTCC  >  minE/1207297‑1207358 |                                                              cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:514409/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:919476/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:883371/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:817621/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:801393/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:782640/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:723384/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:695374/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:594578/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:569037/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:1154911/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:509400/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:470736/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:436353/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:42510/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:328730/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:280329/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:126112/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:125596/62‑1 (MQ=255) cccTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTcc  <  1:1154950/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCTCTGGCCGCTGCGGGCCAGGTACTGACCATCATCGTTCGTACTATTACCGTTGCTTTCC  >  minE/1207297‑1207358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑