Missing coverage evidence...
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TACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGACACA  >  minE/1210514‑1210574 |                                                             tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:66982/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:50087/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:53510/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:56633/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:607455/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:62807/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:637465/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:644773/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:649863/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:668039/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:499062/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:695104/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:790376/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:88802/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:90063/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:913293/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:959843/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:970945/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:998501/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:279141/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1059776/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1081474/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1150524/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1200694/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:229423/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:265471/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:273951/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1016820/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:287462/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:294996/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:331265/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:341164/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:367233/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:381497/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:442158/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:457445/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCAGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:264766/61‑1 (MQ=255) tACGTATTATGGAGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGAcaca  <  1:1080401/61‑1 (MQ=255) |                                                             TACGTATTATGGCGTCCATACTGGTATCGGAAAACGGCAAACGGTGGCTGGAAGCGACACA  >  minE/1210514‑1210574

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑