Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1211256	1211319	64	9 [0]	[0] 62	cspC	stress protein, member of the CspA‑family

AACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGC  >  minE/1211320‑1211381 |                                                              aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGaaa                          >  1:196686/1‑38 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTttcttc    >  1:577091/1‑60 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTttctt     >  1:1121471/1‑59 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:782191/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:612979/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:623233/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:495214/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:436301/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:339645/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:759065/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:261166/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:219889/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:807251/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:196416/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:82448/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:1002781/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:1069052/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCg   >  1:897472/1‑61 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:646756/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:815407/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:606102/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:840764/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:957833/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:950753/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:938233/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:638917/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:644187/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:983857/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:66026/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:726104/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:74328/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:935808/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:934586/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:76718/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:889625/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:778917/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:250157/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1058564/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1081805/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1092459/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1098788/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1111996/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1117408/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1124928/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1142379/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1155035/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:1199530/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:133430/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:207614/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:600702/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:251524/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:282026/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:321087/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:342459/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:344655/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:354199/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:357025/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:425103/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:526227/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:537481/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGc  >  1:537656/1‑62 (MQ=255) aaCCACTTAACCTGACCTATAATCTTTGCCATTTGAAAAAtt                      >  1:427061/1‑42 (MQ=255) |                                                              AACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGC  >  minE/1211320‑1211381

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑