Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1213735	1213735	1	36 [0]	[0] 13	kdgR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

CTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTTCAGG  >  minE/1213736‑1213797 |                                                              cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:1039547/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:1075328/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:108994/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:190677/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:195196/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:327636/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:593565/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:641390/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:682140/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:958851/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcagg  >  1:996550/1‑62 (MQ=255) cTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTtcag   >  1:435908/1‑61 (MQ=255) cTGAGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACTCGCGAgc                        >  1:54999/1‑40 (MQ=38) |                                                              CTGCGCTACGAATTAAATCGACGTTTTGTAACGCGCGAGCGCCCAGTTCAAACAATTTCAGG  >  minE/1213736‑1213797

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑