Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1220066	1220067	2	2 [0]	[0] 78	yebR	conserved hypothetical protein

CCTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGC  >  minE/1220068‑1220113 |                                              ccTGGATCTTCCAGCCTATTAAAATAATCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1003995/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTTATGc  <  1:656247/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAAttc  <  1:529085/46‑3 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:692865/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:709894/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:677798/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:674123/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:67262/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:669688/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:664539/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:659699/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:657581/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:636410/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:600014/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:582920/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:571800/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:550620/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:537855/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:521117/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:502889/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:887602/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:971204/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:9683/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:967399/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:964821/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:950683/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:908989/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:902815/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:898899/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:890079/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:494892/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:850686/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:847386/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:846721/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:842374/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:788719/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:782997/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:765006/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:750434/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:721489/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1112240/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:131413/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:129140/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1190333/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1180674/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1179737/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:117787/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1149409/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1147867/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1126946/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:132849/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1102239/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1092967/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1078155/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1076945/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1053507/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1051082/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1032945/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:1008957/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:310586/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:46191/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:460210/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:446654/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:399659/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:378526/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:35788/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:318565/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:311162/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:48352/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:303575/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:269227/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:245646/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:241187/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:229932/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:229425/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:199414/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGc  <  1:188228/46‑1 (MQ=255) ccTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCAGTAAATGCGTTAATGc  <  1:439403/46‑1 (MQ=255) |                                              CCTGGATCTGCCAGCCTATTAAAATAAGCATTAAATGCGTTAATGC  >  minE/1220068‑1220113

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑