Missing coverage evidence...
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ACCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACGG  >  minE/1253030‑1253091 |                                                              aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTTAGGTGAACgg  <  1:1047804/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:333679/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:944144/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:935073/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:917957/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:882245/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:802719/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:75316/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:717561/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:671656/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:662351/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:610617/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:554210/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:42469/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:41090/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:40138/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:392270/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1018024/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:309586/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:27369/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:215994/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:198524/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:188418/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:187883/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:145931/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1187071/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1178390/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1176846/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1052453/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:103274/62‑1 (MQ=255) aCCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACgg  <  1:1022463/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACCGCATTTTCCGGTGCAGCTTTCAGTTCTGCAGCCGTCATATCTTTCGGTGAGGTGAACGG  >  minE/1253030‑1253091

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑