Missing coverage evidence...
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TCCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGA  >  minE/1272437‑1272497 |                                                             tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAAGAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:932646/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:936744/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:623797/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:626394/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:666517/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:70958/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:784306/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:828576/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:884467/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:584253/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:938779/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:944631/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:951174/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:957848/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:963627/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:970616/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:973096/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:232032/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:108748/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:1108474/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:117347/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:117674/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:1191363/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:1201576/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:123628/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:149372/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:1000430/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:242242/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:26941/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:286672/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:368915/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:543204/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGa  <  1:5584/61‑1 (MQ=255) tcCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTACCGCTTGa  <  1:264658/61‑1 (MQ=255) |                                                             TCCGCAGAACGACTCCCCTCCCCCGGAACAAGCTCGGTTTCATGAAAAGCTTCCCGCTTGA  >  minE/1272437‑1272497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑