Missing coverage evidence...
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AGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAC  >  minE/1285951‑1286010 |                                                            aGATTTTCTGCTATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:742264/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:48363/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:974721/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:974355/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:955932/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:818762/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:796395/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:765905/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:735299/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:726688/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:703007/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:655499/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:650194/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:597252/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:496659/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:1023081/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:357709/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:1062121/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:1096035/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:1097620/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:1164754/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:136789/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:236162/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:271400/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:481238/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:363329/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:396168/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:413924/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:458512/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:461016/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:465581/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:472735/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTACTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:51860/60‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGCACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAc  <  1:878058/60‑1 (MQ=255) |                                                            AGATTTTCTGCAATCGATAATGAAAATGTACGTTCCTGCGAGCTACCTTCTAAATTGAAC  >  minE/1285951‑1286010

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑