Missing coverage evidence...
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GTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGT  >  minE/1296721‑1296766 |                                              gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:344937/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:958947/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:955658/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:880160/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:76008/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:701403/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:637849/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:553652/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:528431/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:470272/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:458977/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:382341/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:1008652/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:343065/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:299966/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:285999/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:272354/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:2148/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:211384/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:127991/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:1175018/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:1109696/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:101521/46‑1 (MQ=255) gTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgt  <  1:1010486/46‑1 (MQ=255) |                                              GTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGT  >  minE/1296721‑1296766

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑