Missing coverage evidence...
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GCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATC  >  minE/1323659‑1323720 |                                                              gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:815188/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:486925/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:500114/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:52108/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:555832/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:616314/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:777838/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:80642/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:810267/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:448373/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:816573/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:847260/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:882439/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:883789/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:918128/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:973040/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:978325/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:101305/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:419890/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:35843/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:356999/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:226186/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:215110/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:213313/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:19071/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:180026/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:177345/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:172322/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:1188780/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:1187749/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:1108413/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:1040398/62‑1 (MQ=255) gCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATc  <  1:1025582/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCGTGATATTGCGGGCTTTGATATTACGAATAACAAAATGTTTACCATTTTCAACATGTATC  >  minE/1323659‑1323720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑