Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1352688	1352690	3	12 [0]	[0] 29	thiD	bifunctional hydroxy‑methylpyrimidine kinase and hydroxy‑phosphomethylpyrimidine kinase

CAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGCC  >  minE/1352691‑1352752 |                                                              cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGGACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:525503/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:573220/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:900951/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:893985/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:890589/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:883281/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:754527/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:751084/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:732018/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:713571/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:712746/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:70696/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:68283/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:643942/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:635199/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:574881/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:1074456/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:459844/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:458291/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:420170/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:419423/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:278944/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:26294/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:256212/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:211327/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:1134361/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:1118958/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:1090607/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGcc  <  1:1078717/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGTACCGGCAATCGTCAGAGCGTTAATTCGTTTCATGCCTGCACCTCCTGCGTCAATTGCC  >  minE/1352691‑1352752

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑