Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1353153	1353224	72	3 [0]	[0] 40	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

CCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCT  >  minE/1353225‑1353286 |                                                              ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGc   >  1:432017/1‑61 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:781961/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:497634/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:50990/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:544238/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:549482/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:709516/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:727424/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:732348/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:738967/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:763497/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:994831/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:791643/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:809950/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:825819/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:827677/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:899469/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:904137/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:957101/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:972826/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:101441/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:174048/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1017219/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1037051/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1046794/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1061277/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1083802/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1122836/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:1166364/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:12935/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:152726/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:4283/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:226469/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:252594/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:29707/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:304100/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:313867/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:356618/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:401027/1‑62 (MQ=255) ccAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCt  >  1:421541/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCAGGGTGTTTGAGAGCTTTTTGCTTGCTCAACGGCAGCACGCATCGCCTGAGCGCGTGGCT  >  minE/1353225‑1353286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑