Missing coverage evidence...
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GCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAG  >  minE/1408055‑1408116 |                                                              gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:822951/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:683423/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:694910/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:695792/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:715926/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:780204/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:788003/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:802164/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:80301/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:808641/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:809103/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:817281/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:682733/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:839281/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:863630/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:890663/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:900103/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:903718/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:912775/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:932090/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:954925/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:968637/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:976783/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:427892/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1056535/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1057909/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1062615/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1150096/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1158859/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1182568/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:139139/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:299892/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:34918/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:383289/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:1001780/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:436856/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:496851/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:500289/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:54267/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:556760/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:568222/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:651626/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:666642/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:668877/62‑1 (MQ=255) gCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAg  <  1:681787/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCATACCCTGGAAAAACAGCTTTATGAAGTGCTTTCACTCCACCGCGGGATGCGTCGGGAAG  >  minE/1408055‑1408116

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑