Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1410460	1410541	82	20 [0]	[0] 14	bcr	bicyclomycin/multidrug efflux system

GCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGA  >  minE/1410542‑1410602 |                                                             gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:1114388/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:1140917/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:1146846/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:1186820/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:212607/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:2301/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:312280/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:401602/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:452856/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:540454/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:541793/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:707581/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:858237/61‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGa  <  1:932615/61‑1 (MQ=255) |                                                             GCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGA  >  minE/1410542‑1410602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑