Missing coverage evidence...
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CGCTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAT  >  minE/1422715‑1422776 |                                                              cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGCCCGACTTCCGGCa   >  1:257873/1‑61 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGCCTTCCGGCAt  >  1:308711/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCa   >  1:1094029/1‑61 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:690189/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:3769/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:391668/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:420318/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:596563/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:610551/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:632150/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:275295/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:748412/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:793062/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:830270/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:844725/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:852380/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:987090/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:319992/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:1020948/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:269043/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:240283/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:223725/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:215588/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:173300/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:144294/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:124387/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:122913/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:1138385/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:1109815/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:1048203/1‑62 (MQ=255) cgcTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAt  >  1:1036922/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGCTGCACACTACCCGGCATCACCATCCCGCCAACGCGCAGACGCTGACCGACTTCCGGCAT  >  minE/1422715‑1422776

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑