Missing coverage evidence...
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TCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGC  >  minE/1424489‑1424547 |                                                           tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCTAAACg             >  1:798228/1‑48 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACg      >  1:1016430/1‑55 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAg   >  1:1124507/1‑58 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:770174/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:450945/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:530732/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:545799/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:55838/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:609481/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:612414/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:668749/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:671883/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:748759/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:428760/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:874411/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:888108/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:904544/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:953118/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:965285/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:973715/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:994136/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:168458/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1069834/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1094789/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1121069/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1153887/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1184263/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1189194/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:167051/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:450239/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:182931/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:186333/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:187865/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:229902/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:252307/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:29103/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:365146/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:403613/1‑59 (MQ=255) tCAGGAAGAACAACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGc  >  1:1189807/1‑59 (MQ=255) |                                                           TCAGGAAGAACCACAGCGGGTTGGCGATTTCGGCGCTATGGCGAAACGCTACACGCAGC  >  minE/1424489‑1424547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑