Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1441508	1441541	34	5 [0]	[0] 32	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

CCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGC  >  minE/1441542‑1441601 |                                                            ccGGATTTAAAGAATCGCCCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:452357/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:806653/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:614572/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:61620/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:638470/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:647390/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:70201/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:733919/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:797576/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:608172/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:863863/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:88841/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:906754/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:916206/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:969327/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:969416/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:974425/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1020814/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:605908/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:462273/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:432029/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:37006/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:207235/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:168152/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:11805/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1152158/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:114569/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1139668/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1111770/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1089186/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1076273/1‑60 (MQ=255) ccGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGc  >  1:1021082/1‑60 (MQ=255) |                                                            CCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGTGCAGAGATGTTGC  >  minE/1441542‑1441601

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑