Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1441808	1441993	186	15 [0]	[1] 36	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGA  >  minE/1441993‑1442055  |                                                              tttGCTGGCGCTGGCGT‑‑TTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1187989/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:72645/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1058243/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:427260/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:445239/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:564547/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:57317/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:576454/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:655430/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:701451/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:396708/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:752426/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:752792/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:752807/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:786974/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:851275/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:878627/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:896497/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:240854/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1120748/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1173911/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1196743/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:123690/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:15237/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:191405/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:209883/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:395312/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:242295/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:268201/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:28409/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:316396/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:371596/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:386304/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGAAGTACAGa  <  1:511354/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCAATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:49966/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTACGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa  <  1:1140913/62‑1 (MQ=255)  |                                                              TTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGA  >  minE/1441993‑1442055

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑