Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1443159 1443305 147 21 [0] [0] 30 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCA  >  minE/1443306‑1443366
|                                                            
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTa      >  1:29602/1‑57 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc   >  1:640125/1‑60 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc   >  1:574281/1‑60 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:490566/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:963882/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:936155/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:823472/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:804337/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:703026/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:690920/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:670371/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:608358/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:592826/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:582270/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:52071/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:501305/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:1020534/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:471852/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:356183/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:352098/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:284941/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:277047/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:25994/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:119063/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:1174504/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:1153336/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:1106318/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:1062907/1‑61 (MQ=255)
gCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:105097/1‑61 (MQ=255)
gCGAACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCa  >  1:221205/1‑61 (MQ=255)
|                                                            
GCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCA  >  minE/1443306‑1443366

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: