Missing coverage evidence...
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ATTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACAAAAAAAATGC  >  minE/1485833‑1485895 |                                                               aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATAc                       >  1:43672/1‑42 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:670223/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:353001/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:402838/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:45271/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:488650/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:523556/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:534198/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:543007/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:598650/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:617652/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:621232/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:633903/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:339046/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:675323/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:683961/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:726731/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:780943/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:804868/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:815418/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:816457/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:845971/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:899274/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:946593/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:974693/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:979583/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1181705/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:101858/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1055331/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1096645/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1112189/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1138578/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1141099/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1151750/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1163286/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1163982/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1177424/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1178332/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:1001182/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:150359/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:175301/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:210044/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:218484/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:263956/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:307781/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:314739/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:317884/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaaa     >  1:324102/1‑60 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaaa      >  1:1026041/1‑59 (MQ=255) aTTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACaaaaaa       >  1:1202204/1‑58 (MQ=255) aTTGCACG‑GGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACAAAAAAAATGc  >  1:282526/1‑62 (MQ=255) |                                                               ATTGCACGCGGACCTCTCCCTGTTAAAAGCCTCACATTATACGGGGTACTACAAAAAAAATGC  >  minE/1485833‑1485895

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑