Missing coverage evidence...
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CCTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTCC  >  minE/1526737‑1526798 |                                                              ccTTCAGCTCCTTAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:717122/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTc                            >  1:1048527/1‑36 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:667095/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1006377/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:407878/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:408299/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:424486/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:444987/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:504095/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:577480/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:611212/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:64767/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:394823/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:755325/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:769917/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:850252/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:890330/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:946481/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:952029/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:971372/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:192744/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1034500/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1053703/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1096665/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:112886/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1142905/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:1155135/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:135070/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:170546/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:393208/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:212369/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:229580/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:282939/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:305165/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:35639/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTcc  >  1:391778/1‑62 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTc   >  1:1196204/1‑61 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTc   >  1:468346/1‑61 (MQ=255) ccTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTc   >  1:288913/1‑61 (MQ=255) ccTTCAGCTACTGAGAGATAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGc            >  1:601790/1‑52 (MQ=255) |                                                              CCTTCAGCTCCTGAGAGAAAGTGATCCCTGAACGTCCTTCACGCAGAGATGCCAGGACTTCC  >  minE/1526737‑1526798

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑