Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1656502	1656790	289	8 [0]	[0] 83	ppk	polyphosphate kinase, component of RNA degradosome

GGAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTACC  >  minE/1656791‑1656852 |                                                              ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCTTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:632757/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGCCCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:146269/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAATATTAACATTTAcc  >  1:707721/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:583514/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:763265/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:758163/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:732891/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:732750/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:704285/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:641974/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:630577/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:782476/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:576570/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:555516/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:544388/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:537659/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:522004/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:505039/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:499869/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:476188/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:471211/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:834447/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:976477/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:974196/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:926255/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:919274/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:913760/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:906320/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:887693/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:852214/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:835013/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:765910/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:83335/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:82837/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:820662/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:812392/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:812154/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:805460/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:796999/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:785955/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:468038/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1171058/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:257500/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:240818/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1040695/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:222558/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:176721/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:174298/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:146369/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:145048/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1190188/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:232290/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1168999/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:116287/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1133078/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1114686/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1081643/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1072153/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1066166/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1049334/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:266329/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:448312/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:407158/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:390834/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:388929/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:375420/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:364598/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:359787/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:350989/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:347454/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:321880/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:315294/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:309622/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:303741/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:283116/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:269168/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:259976/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAc   >  1:1126157/1‑61 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAAATAACATTTAc   >  1:316717/1‑61 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTAGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1066234/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCGTCAGGCGTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:942978/1‑62 (MQ=255) ggAACTGCTGCCTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:1117616/1‑62 (MQ=255) ggAAATGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTAcc  >  1:833823/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGAACTGCTGCGTCAGGCTTCGTTCGACCCGAGCGTACTGGCGATTAAAATTAACATTTACC  >  minE/1656791‑1656852

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑